刘宗周本无意出山，他认为朝中正邪并立，党争不断，中兴大明的事业举步维艰，自己到了南京也很难有所作为，于是在连续上书的同时，又不断地向朝廷告假，可弘光帝就是不批准，并催促他速速进京。

刘宗周只得动身前往南京，出发前他给弘光帝再写一篇奏疏。

先前的两篇奏疏虽然被收藏进了国史馆保存，但皇上却迟迟没有行动，刘老头决定改变策略，不再全面出击，四面树敌。他清楚现在朝中的混乱局面都是大权在握的马士英一手造成的，于是决定集中火力，专门瞄准马士英。

他的第三篇奏疏的标题叫做《特陈阴阳消长之兆以资庙算疏》。这里的“阴”指小人，“阳”指君子，阴阳消长也就是正邪不两立，冰火不相容的意思。在这里，刘宗周语重心长地告诉皇帝：

陛下您能够登上九五之尊，完全是上天恩赐，并非人力所为。有的人只有一些护驾微劳，就进入内阁，独揽大权，接受少傅，太保之类的官衔和世代传承的荫赏，并且心安理得，毫无疑惧，这个人不就是原凤阳总督马某人吗？

在马某人的庇护下，诚意伯刘孔昭欺辱天官（指吏部尚书），叫嚣朝堂，吏科给事中李沾借“定策”危言耸听，挑拨君臣关系。趁着朝堂混乱，争吵不休，躲在暗处的一些阴险小人也开始走上前台，弹冠相庆了。

在马某人的庇护下，溃逃的败将高杰有恃无恐，残害百姓，刘，黄诸将，各弃汛地，如同弈棋，把国事纯粹当成儿戏。在飞扬跋扈的内斗中，南朝建立已有两月，我军却不能跨出江北一步。

最后，刘先生给朱由崧出主意说：为了江山社稷考虑，陛下应该发挥马某人通晓军事的特长，把他调出内阁，仍旧担任凤阳总督，让他联络江北四镇，筹划用兵方略，督师史可法即使不调回中央政府，也应在淮河以北，黄河以南，选择一处险要之地，另建督师官署，与马某人形成掎角之势。

弘光帝读罢这篇奏疏，瞧瞧马士英，不置可否，只是继续催促刘宗周入京任职。

但这一回马士英却沉不住气了，差点被刘老头给气哭了。他纳闷刘宗周身在地方，为什么对朝廷的事情如此门清呢？铁哥们阮大铖私下告诉他：“肯定是姜曰广这个老贼在背后指使的。”